<em id="6tv1t"><strike id="6tv1t"><noframes id="6tv1t">

  • <legend id="6tv1t"></legend>
  • <ol id="6tv1t"><blockquote id="6tv1t"></blockquote></ol>

    <span id="6tv1t"><output id="6tv1t"><nav id="6tv1t"></nav></output></span>

    <legend id="6tv1t"><font id="6tv1t"><tbody id="6tv1t"></tbody></font></legend>

    當前位置:首頁 > 技術交流 > 最新應用

    技術交流

    掃描二維碼
    或添加“GeneGroup003
    獲取更多更新資訊

    商城訂購

    掃描二維碼
    或添加“基因商城(GeneMart)
    手機下單,快人一步

    售后服務

    掃描二維碼
    或添加“GeneGroup005
    獲取更快速售后支持

    2020最值得期待的技術之 Visium空間轉錄組,帶您探索新維度

    版權所有,轉載請聯系基因市場部
    2020-03-04



    傳統的轉錄組學研究手段(表達譜芯片/Bulk RNA-seq)通常將組織或者細胞全部研磨抽提總RNA,這樣做的結果是得到所有細胞的平均基因表達水平,細胞的異質性會被掩蓋。事實上每種類型的細胞有著不同的表達譜,近幾年的單細胞測序很好的解決了這個問題,它能夠揭示成千上萬細胞的異質性和亞群表達差異,甚至是新細胞亞群。只做到這些還是不夠的,沒有空間位置上的信息,不能反映某一細胞群在組織上的哪些區域表達。而這些對研究組織整個發育進程,了解腫瘤的異質性,了解免疫的浸潤性是至關重要的。此外,傳統的免疫組化和原位雜交實驗,只能得到少數已知基因在組織上的定位情況,并不能一次實驗所有基因都觀察得到。2020年,10x Genomics Visium空間轉錄組技術的到來,讓這些問題迎刃而解,真正實現轉錄組時空性研究在空間維度上的突破。




    Visium空間轉錄組技術原理

    Visium空間轉錄組研究是將組織學研究(切片和H&E染色)與轉錄組學研究(芯片技術&測序技術)結合,實現空間信息和轉錄本信息的同時獲得,沒有組織解離引入的偏好性,保留組織構造和細胞微環境,在異質性的組織中鑒定細胞的類型。

    沒有組織解離引入的偏好性,保留組織的構造和細胞微環境,在異質性的組織中鑒定細胞類型。并通過PolyA捕獲以及創新的空間條形碼技術制備RNA測序文庫,定位繪制復雜組織樣本空間上的基因表達。

    Visium空間轉錄組使用特制的載玻片,即特質的芯片,它上面有數千個由條形碼標記的空間位置點(spots),每個點(spot)包含的數百萬條捕獲寡核苷酸探針并帶有獨一無二的空間條形碼(圖1)。組織切片進行固定,染色,透化后釋放mRNA與組織相應位置附近的捕獲寡核苷酸探針結合。逆轉錄反應也在載玻片上原位進行,后續生成的cDNA文庫包含空間條碼并保存空間信息。條碼標記的cDNA文庫被映射回捕獲區域的特定空間位置點(spot)?;虮磉_數據隨后疊加到高分辨率顯微鏡下的組織切片圖像中,實現以空間分辨率的方式觀察組織形態學背景下可視化任何mRNA或mRNA組合表達的空間分布。

    圖1. Visium 原理示意圖(來自10X genomics Visium)


    Visium空間轉錄組應用領域

    空間轉錄組的應用方向包含了腫瘤學,免疫學,發育生物學,神經科學及病理學。

    截止2020年2月,該技術已成功用于胰腺導管腺癌、人類心臟的發育、肌萎縮性側索硬化癥、III期皮膚惡性黑色素瘤、乳腺癌、前列腺癌等多種疾病癌癥及組織發育時空表達等研究中,且研究成果大都發表在Science、cell等高水平期刊。歡迎留言或咨詢,可送上相關數十篇文獻。



    基因集團貝晶生物致力提供專業的Visium空間轉錄組服務

    基因集團上海貝晶生物技術有限公司十多年來一直致力于轉錄組服務及相關數據分析,服務用戶發表了很多高質量的論文,不乏在署名作者以及致謝中提及我司及生信人員的例子。


    10x Genomics公司推出突破性的Visium空間轉錄組解決方案后,我司作為中國簽約服務商立即引入該項目,向廣大用戶提供全方位的空間轉錄組服務。


    1. 完善的實驗平臺——官方推薦認可的儀器設備及試劑

    2. 優秀的技術團隊——國內知名高校的資深實驗團隊以及具備自主研發軟件的生信團隊

    3. 一站式的服務——提供從組織切片、染色、透化、文庫構建、測序到數據分析以及結果可視化的全程服務。



    貝晶空間轉錄組服務流程



    貝晶空間轉錄組生信分析

    秉承官方的數據分析,超越與擴展更多的分析


    1. 基于整體轉錄組的聚類 (更優秀的聚類算法)


    2. 基于基因水平的聚類(共表達分析 圖2) New!


    3. 基于空間信息的差異基因檢出(圖3)New!

    圖2. 基于基因共表達的聚類

    圖3. 基于空間信息的差異基因檢出



    如果您是從事腫瘤、免疫、發育生物學、神經科學、病理學等方面研究;如果您想更全面的了解Visium空間轉錄組,請您聯系身邊的基因人索取空間轉錄組服務手冊及相關文獻。

    基因有限公司/上海貝晶生物技術公司

    郵箱:order@genecompany.com(基因)

            info@baygene.com(貝晶)

    電話:

    021-64951899-292


    歡迎關注我司“基因快訊”與“基因售后服務”官方微信

    滬公網安備 31010402003540號

    滬ICP備19021954號-2

    无码国产在线视频看,色天天综合网视频网站,久久人人97超碰,在线综合 亚洲 欧美 在线,无码国产在线视频看